志愿结构分为批次结构和专业结构。批次结构是指录取志愿共设几个批次和各批次之间的录取顺序。2010年，重庆市普通高校志愿批次结构共安排了本科提前批、本科第一批、本科第二批、本科第三批、高职专科提前批、高职专科一阶段、高职专科二阶段等。在实际录取过程中，按上述批次依次进行。
本科提前批：主要是本科层次的军队、公安、司法院校的计划，教育部直属师范院校的计划，香港中文大学、香港城市大学以及有特殊要求(如航海、轮机专业等)的本科计划;本科第一批：主要是“985工程”院校、“211工程”院校的计划和经批准纳入该批录取的院校计划;本科第二批：主要是一般本科院校的计划和经批准纳入该批录取的应用技术本科计划;本科第三批：主要是独立学院、民办高校的本科计划和应用技术本科计划;高职专科提前批：主要是公安、司法、航海、空乘和有特殊要求的高职专科计划;高职专科一阶段：主要是本科院校和普通专科院校的高职专科计划;高职专科二阶段：主要是独立学院、民办高校和独立设置的高职学院的高职专科计划。
志愿结构为：本科提前批和高职专科提前批设一个一志愿和一个二志愿;本科第一批设六个平行志愿;本科第二批、本科第三批和高职专科一阶段设一个一志愿、两个平行的二志愿和三个平行的三志愿;高职专科二阶段设三个平行志愿。如果在录取时部分高校未能完成计划，除本科提前批和高职专科提前批外均采用网上二次征集志愿的办法征集志愿。每批次均设六个专业志愿。三校生类在高职专科二阶段不按平行志愿投档，而是按照A、B、C的先后志愿顺序投档。
